MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Meiothermus ruber DSM 1279 genome

Total Repeats: 62970

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_021081	TCC	2	6	23380	23385	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482881666
502	NC_021081	G	6	6	23430	23435	0 %	0 %	100 %	0 %	482881666
503	NC_021081	GGGT	2	8	23471	23478	0 %	25 %	75 %	0 %	482881666
504	NC_021081	CCG	2	6	23486	23491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881666
505	NC_021081	TGC	2	6	23518	23523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881666
506	NC_021081	CTG	2	6	23571	23576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881666
507	NC_021081	AGA	2	6	23629	23634	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482881666
508	NC_021081	GCCGCT	2	12	23645	23656	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	482881666
509	NC_021081	TGA	2	6	23918	23923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482881667
510	NC_021081	GGC	2	6	23949	23954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881667
511	NC_021081	TGG	2	6	24020	24025	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881667
512	NC_021081	CTTT	2	8	24062	24069	0 %	75 %	0 %	25 %	482881667
513	NC_021081	G	6	6	24073	24078	0 %	0 %	100 %	0 %	482881667
514	NC_021081	A	6	6	24090	24095	100 %	0 %	0 %	0 %	482881667
515	NC_021081	ATG	3	9	24109	24117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482881667
516	NC_021081	TGTGGC	2	12	24138	24149	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	482881667
517	NC_021081	TTG	2	6	24157	24162	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482881667
518	NC_021081	AAC	2	6	24226	24231	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482881667
519	NC_021081	GAT	2	6	24288	24293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482881667
520	NC_021081	CGGTG	2	10	24336	24345	0 %	20 %	60 %	20 %	482881667
521	NC_021081	TCA	2	6	24380	24385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482881667
522	NC_021081	G	7	7	24431	24437	0 %	0 %	100 %	0 %	482881667
523	NC_021081	CGG	2	6	24474	24479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881667
524	NC_021081	GGT	2	6	24483	24488	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881667
525	NC_021081	GGT	2	6	24513	24518	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881667
526	NC_021081	AGC	2	6	24519	24524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881667
527	NC_021081	GCG	2	6	24601	24606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881667
528	NC_021081	TTG	2	6	24607	24612	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482881667
529	NC_021081	GGC	2	6	24651	24656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881667
530	NC_021081	CCA	2	6	24707	24712	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881667
531	NC_021081	GGCT	2	8	24767	24774	0 %	25 %	50 %	25 %	482881667
532	NC_021081	TGG	2	6	24785	24790	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881667
533	NC_021081	TGG	2	6	24794	24799	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881667
534	NC_021081	GCT	2	6	24814	24819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881667
535	NC_021081	TC	3	6	24824	24829	0 %	50 %	0 %	50 %	482881667
536	NC_021081	GATG	2	8	24906	24913	25 %	25 %	50 %	0 %	482881667
537	NC_021081	GTTT	2	8	25001	25008	0 %	75 %	25 %	0 %	482881667
538	NC_021081	GGT	2	6	25071	25076	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881667
539	NC_021081	TGC	2	6	25100	25105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881667
540	NC_021081	TGG	2	6	25112	25117	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881667
541	NC_021081	C	6	6	25127	25132	0 %	0 %	0 %	100 %	482881667
542	NC_021081	GAA	2	6	25150	25155	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482881667
543	NC_021081	GGGT	2	8	25157	25164	0 %	25 %	75 %	0 %	482881667
544	NC_021081	CGG	2	6	25262	25267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881667
545	NC_021081	TGA	2	6	25291	25296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482881668
546	NC_021081	CAT	2	6	25310	25315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482881668
547	NC_021081	ATCA	2	8	25376	25383	50 %	25 %	0 %	25 %	482881668
548	NC_021081	CGG	2	6	25400	25405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881668
549	NC_021081	TAC	2	6	25436	25441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482881668
550	NC_021081	TTG	2	6	25498	25503	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482881668
551	NC_021081	ACA	2	6	25758	25763	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482881669
552	NC_021081	CCG	2	6	25779	25784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881669
553	NC_021081	AG	3	6	25807	25812	50 %	0 %	50 %	0 %	482881669
554	NC_021081	TCG	2	6	25829	25834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881669
555	NC_021081	CCA	2	6	25845	25850	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881669
556	NC_021081	CCCTCG	2	12	25862	25873	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	482881669
557	NC_021081	GCT	2	6	25974	25979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881669
558	NC_021081	GCG	2	6	26064	26069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881669
559	NC_021081	TTC	2	6	26080	26085	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482881669
560	NC_021081	CAC	2	6	26089	26094	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881669
561	NC_021081	GAT	2	6	26125	26130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482881669
562	NC_021081	CAC	2	6	26167	26172	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881669
563	NC_021081	CAA	2	6	26173	26178	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482881669
564	NC_021081	CGC	2	6	26187	26192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881669
565	NC_021081	CCA	2	6	26253	26258	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881669
566	NC_021081	GTG	2	6	26273	26278	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881669
567	NC_021081	GTTTTA	2	12	26556	26567	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	482881670
568	NC_021081	CTG	2	6	26574	26579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881670
569	NC_021081	CAC	2	6	26580	26585	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881670
570	NC_021081	TGG	2	6	26654	26659	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881670
571	NC_021081	GGT	2	6	26714	26719	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881670
572	NC_021081	TCCA	2	8	26736	26743	25 %	25 %	0 %	50 %	482881670
573	NC_021081	GAG	2	6	26746	26751	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482881670
574	NC_021081	C	6	6	26850	26855	0 %	0 %	0 %	100 %	482881670
575	NC_021081	GA	3	6	26879	26884	50 %	0 %	50 %	0 %	482881670
576	NC_021081	CCA	2	6	26891	26896	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881670
577	NC_021081	AGA	2	6	26999	27004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482881670
578	NC_021081	GCT	2	6	27022	27027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881670
579	NC_021081	GCG	2	6	27040	27045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881670
580	NC_021081	ATG	2	6	27073	27078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482881670
581	NC_021081	CAA	2	6	27155	27160	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482881670
582	NC_021081	CTT	2	6	27165	27170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482881670
583	NC_021081	TCC	2	6	27196	27201	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482881670
584	NC_021081	ATC	2	6	27211	27216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482881670
585	NC_021081	GTG	2	6	27222	27227	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881670
586	NC_021081	GAT	2	6	27243	27248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482881670
587	NC_021081	GTG	2	6	27259	27264	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881670
588	NC_021081	AGT	2	6	27323	27328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482881670
589	NC_021081	TCG	2	6	27370	27375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881670
590	NC_021081	ACC	2	6	27382	27387	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881670
591	NC_021081	GCT	2	6	27413	27418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881670
592	NC_021081	CGTT	2	8	27505	27512	0 %	50 %	25 %	25 %	482881670
593	NC_021081	ATG	2	6	27598	27603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482881670
594	NC_021081	GTA	2	6	27955	27960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482881671
595	NC_021081	CAGC	2	8	27965	27972	25 %	0 %	25 %	50 %	482881671
596	NC_021081	GCT	2	6	28097	28102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881671
597	NC_021081	GGC	2	6	28160	28165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881671
598	NC_021081	TGG	2	6	28189	28194	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881671
599	NC_021081	CCGG	2	8	28199	28206	0 %	0 %	50 %	50 %	482881671
600	NC_021081	TGC	2	6	28312	28317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881671
601	NC_021081	TGC	2	6	28342	28347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881671
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605	NC_021081	GCA	2	6	28719	28724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881672
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607	NC_021081	CTG	2	6	28780	28785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881672
608	NC_021081	TGC	2	6	28826	28831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881672
609	NC_021081	GGC	2	6	28839	28844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881672
610	NC_021081	GGC	2	6	28851	28856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881672
611	NC_021081	T	6	6	28857	28862	0 %	100 %	0 %	0 %	482881672
612	NC_021081	GGA	2	6	28929	28934	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482881672
613	NC_021081	C	6	6	28976	28981	0 %	0 %	0 %	100 %	482881672
614	NC_021081	CGG	2	6	29051	29056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881672
615	NC_021081	GGTGG	2	10	29083	29092	0 %	20 %	80 %	0 %	482881672
616	NC_021081	TCT	2	6	29129	29134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482881672
617	NC_021081	CAG	2	6	29170	29175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881672
618	NC_021081	TG	3	6	31721	31726	0 %	50 %	50 %	0 %	482881673
619	NC_021081	CCCA	2	8	31727	31734	25 %	0 %	0 %	75 %	482881673
620	NC_021081	ACC	2	6	31736	31741	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881673
621	NC_021081	CAG	2	6	31745	31750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881673
622	NC_021081	CGC	2	6	31753	31758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881673
623	NC_021081	CGA	2	6	31840	31845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881673
624	NC_021081	TGGC	2	8	31901	31908	0 %	25 %	50 %	25 %	482881673
625	NC_021081	CG	3	6	31938	31943	0 %	0 %	50 %	50 %	482881673
626	NC_021081	TGG	2	6	31965	31970	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881673
627	NC_021081	TGG	2	6	32046	32051	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881673
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